中心碳代谢传统意义上包括TCA、糖酵解、磷酸戊糖途径。中心碳代谢是生物体所需能量的主要来源，并且其体内其他代谢物提供前体物质，且CCM中关键酶的酶活及蛋白表达水平具有遗传分辨性，类似于表型，可用于大致的种属分辨。鉴于CCM在所有生命体中的重要作用，研究其代谢物的表达具有非常重要的意义。液质联用方法（LC-QQQ-MS）可以高通量检测样本中心碳代谢通路中各物质的含量，通过数据分析以确定物质间的变化关系。